熟練掌握生物信息分析及編程知識(shí),熟悉單細(xì)胞組學(xué)、表觀基因組學(xué)、遺傳易感性、腫瘤多組學(xué)等研究的數(shù)據(jù)分析方案,
了解GEO等多種生物信息數(shù)" />
熟練使用R語言,熟悉python,和Linux常用命令,運(yùn)用office等常用的辦公軟件
熟練掌握生物信息分析及編程知識(shí),熟悉單細(xì)胞組學(xué)、表觀基因組學(xué)、遺傳易感性、腫瘤多組學(xué)等研究的數(shù)據(jù)分析方案,
了解GEO等多種生物信息數(shù)據(jù)庫
1.背景降噪系統(tǒng)研發(fā)(基于UMI處理)
? 基于UMI處理,從不同角度比較sentieon和fgbio處理的效果,挑選合適的工具為后續(xù)的變異檢測(cè)做準(zhǔn)備。
2.高通量測(cè)序性能評(píng)價(jià)
? 根據(jù)不同的性能參數(shù),挑選適合人和微生物的測(cè)序平臺(tái)。
3. MSI檢測(cè)流程開發(fā)
? 研究內(nèi)容是調(diào)研MSI相關(guān)信息,根據(jù)市場(chǎng)產(chǎn)品參數(shù)制定標(biāo)準(zhǔn),篩選工具算法并進(jìn)行對(duì)比,利用模擬數(shù)據(jù)搭建開發(fā)流程。
4. 以單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)解析近視形成過程中鞏膜異質(zhì)性變化特征
? 研究內(nèi)容是全面解析鞏膜組織細(xì)胞細(xì)胞組成特征,獲取近視形成過程中鞏膜成纖維細(xì)胞的亞類分布及變化特征,獲取特異
性基因等
5. DNA甲基化報(bào)告系統(tǒng)開發(fā)
? 基于R的DNA甲基化芯片基礎(chǔ)分析及報(bào)告系統(tǒng)。
6. 基于GEO數(shù)據(jù)庫的腫瘤藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)
? 基于GEO數(shù)據(jù)庫,利用python和R進(jìn)行單細(xì)胞分析發(fā)現(xiàn)腫瘤藥物靶點(diǎn)。
是一個(gè)簡單的代碼流程: 基于人和微生物對(duì)測(cè)序平臺(tái)的需求,同時(shí)根據(jù)中華人民共和國醫(yī)藥標(biāo)準(zhǔn)中高通量基因測(cè)序儀的規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)以及公司已定微生物性能標(biāo)準(zhǔn)開發(fā)高通量測(cè)序儀性能評(píng)價(jià)流程。 本產(chǎn)品使用于人和微生物高通量測(cè)序儀性能評(píng)價(jià),所包含的處理流程有:數(shù)據(jù)預(yù)處理,比對(duì)和BAM文件處理,尋找變
MSI檢測(cè)流程開發(fā) 研究內(nèi)容是調(diào)研MSI相關(guān)信息,根據(jù)市場(chǎng)產(chǎn)品參數(shù)制定標(biāo)準(zhǔn),篩選工具算法并進(jìn)行對(duì)比,利用模擬數(shù)據(jù)搭建開發(fā)流程。